本发明公布了基于厌氧发酵技术分解秸秆并制取清洁能源的方法，其方法在于，S1：拨动导料板并向投料口内投放碎粒状秸秆；S2：处于连通状态下的引料通道可接通投料口、中心流道，处于断开状态下的引料通道可隔绝投料口、中心流道之间的连接；实现牲畜粪便经过导料板、引料通道、中心流道流向发酵池体的中间位置处；S3：发酵池体内的菌种分解发酵原料并制取沼气并且发酵产生的沼气将被浮罩、固定罩所收集，并实现投料口、掏料口内的沼液液面上升；S4：通过导气装置将先将浮罩内的沼气导出，浮罩内的气压值降低，并且浮罩所受的浮力逐步降低，从而使得引料通道开启，S5：通过导气装置再将固定罩内的沼气导出，固定罩内的沼气导出过程中，贮水间内积存的沼液将大量回流。